انخرط الدكتور شفيق الرحمن في الحياة السياسية عبر حزب جاشد الشيوعي الطلابي الذي انتسب إليه في عام 1973 ،وبعد تأسيس اتحاد الطلاب الإسلامي انضم إلى القافلة الدينية عام 1977مقتنعًا بمبادئ الدين الإسلامي  والتعاليم والقيم الإسلامية السمحة ،وتدرج فيما بعد في اتحاد الطلاب الإسلامي إلى أن أصبح رئيسا لفرع كلية الطب في سيلهت ورئيس فرع مدينة سيلهت.

دخل الميدانالسياسي من أوسع أبوابه بانضمامه للجماعة الإسلامية عام 1984 ،تدرج في المناصب القيادية للجماعة الإسلامية للمدينة ،حيث أصبح أميرا للجماعة الإسلامية لمدينة سيلهيت والمناطق التابعة لها. تولى منصب الأمين العام للجماعة الإسلامية من عام 2016 إلى عام 2019 بنجاح ،وفي 12 نوفمبر 2019 تم انتخابه أميرًا للجماعة الإسلامية عن طريق التصويت المباشر لأعضاء الجماعة الإسلامية ، وفي 5 ديسمبر 2019 أدى اليمين الدستورية كأمير للجماعة الإسلامية للفترة الرئاسية 2020-2022.

المناصب القيادية التي تولاها الشيخ الدكتور شفيق الرحمن :

1975: انتخب عضوا في مجلس الشورى في المجلس المركزي

1986: سكرتيرمقاطعة سيلهيت

1989-1991نائب أمير مقاطعة سيلهت

1996-1991: أمير الجماعة الإسلامية لمقاطعة سيلهيت

: 1996 عضو مجلس العمل المركزي

1996 -  2000 أمير الجماعة الإسلامية لبلدية سلهت

: 2010 الأمين العام المساعد للجماعة الإسلامية

2011 عضو المجلس التنفيذي المركزي

2011 -2016القائم بأعمال الأمين العام للجماعة الإسلامية

2018-2019: أمين عام الجماعة الإسلامية

2020 أمير الجماعة الإسلامية